Преподобний Іоанн вже після тридцятирічного перебування в затворі сподобився від Бога благодатного дару прозорливості. Так, імператору Феодосію Великому (379-395) він передбачив перемогу над його супротивниками, Максимом та Євгенієм, і переможну війну проти галлів. Багатьом тим, що відвідувала його, він передбачав події їх життя і давав настанови. Святий подвижник роздавав, хворим, які приходили освячений єлей, помазуючись яким, вони зцілювалися від різних недуг. Преподобний Іоанн передбачив іноку Палладію, описувачу його житія, що він буде єпископом. Передбачення прозорливця виповнилося, і Палладій був поставлений єпископом в Віфінії (Мала Азія).
Преподобний Іоанн у своїх настановах заповідав перш за все мати смирення: “Наслідуйте в міру сил ваших доброчесне життя святих отців і, якщо виконаєте все, то на себе не надійтесь і собою не хваліться. Є багато таких людей, які, досягнувши досконалості в чеснотах і возгордившись , впав з висоти в прірву. – Ретельно спостерігайте: чи старанні ваші молитви? Чи не порушена чистота серця вашого? Чи не зайнятий розум ваш сторонніми думками під час молитви? Спостерігайте, чи всією душею своєю ви відвернулись від світу? Чи не ходите спостерігати за чужими чеснотами, марнославствуючи в той же час своїми власними чеснотами? Чи піклуєтеся про те, щоб представити собою добрий приклад іншим людям? Дивіться, не вважає себе праведними, не загордиться яким не будь своїм добрим ділом. Дивіться, щоб під час молитви вам не приходили в голову думки про речі мирські, тому що немає нічого більш безрозсудного, як устами розмовляти з Богом, думкою ж бути далеко від Нього. Це часто трапляється з тими, які не стільки відрікаються від світу, скільки піклуються про те, щоб догодити світу. Людина, що думає про багато речей, віддається піклуванням про мирське і тління, але, віддаючись піклуванню про мирське, людина не може вже духовними своїми очима бачити Бога. Людині, яка завжди думає про Бога, повинні бути чужі думки про все суєтне. Тій же людині, яка досягла деякого пізнання Бога (повного пізнання Бога ніхто не може досягти), відкриваються таємниці Божі, і вона бачить майбутнє як сьогодення і, подібно святим, творить чудеса і отримує за своєю молитвою все, що тільки попросить від Бога …
Любіть безмовність, чада, перебуваючи завжди в Богомисленні і благаючи завжди Бога про те, щоб Він дарував вам розум чистий, вільний від гріховних помислів. Гідний похвали, звичайно, і той подвижник, який, живучи в світі, вправляється в чеснотах, приймаючи подорожніх, або подаючи милостиню, або допомагаючи в трудах іншим, або перебуваючи постійно без гніву. Така людина гідна похвали, тому що перебуває в чесноті, виконує заповіді Господні, не залишаючи і земних справ. Але краще того й гідний більшої похвали буде той, хто, перебуваючи постійно в Богомисленні, від речового сходить до нематеріального, надаючи речове піклуванню і турботі інших, сам же прагнучи до Небесного, постійно стоячи перед Богом, відмовившись від усього мирського і вже не прив’язуючись знову до світу турботами про земне. Така людина близька до Бога, Якого вона прославляє невпинно в молитвах і псалмоспівах “.
Цими та подібними спасенними настановами, повчальними розповідями і прикладом равноангельского життя преподобний приніс багато духовної користі людям.
Преподобний Іоанн Єгипетський дожив до глибокої старості і відійшов до Господа в 395 році, у віці дев’яноста років.
